Indonesia memiliki peran dalam mendamaikan beberapa negara di ASEAN. Selain mendamaikan antara negara Kamboja dan Vietnam, Indonesia juga berperan dalam mendamaikan Filipina dan Gerakan Pembebasan Moro.

Saat itu, Bangsa Moro ingin berpisah dari Filipina. Maka, Indonesia berupaya untuk merundingkan perdamaian antara pemerintah Filipina dan Gerakan Pembebasan Moro. Indonesia meminta pemerintah Filipina hidup damai dengan umat muslim Moro. Indonesia kemudian membawa masalah Bangsa Moro dan Filipina ke Forum Menteri Luar Negeri Negara Muslim dan dibentuklah Komite Enam, dengan Indonesia sebagai ketua.

Konflik antara Filipina dan bangsa Moro tidak mudah diselesaikan. Namun Indonesia terus dipilih menjadi fasilitator dalam mendamaikan kedua belah pihak, karena jumlah umat muslim terbesar ada di Indonesia, sehingga punya kepemimpinan yang kuat di kawasan ASEAN. Selain itu, Indonesia memiliki pengalaman dalam menyelesaikan masalah Kamboja. Setelah mediasi yang cukup panjang, tercapailah perjanjian damai antara Filipina dan Bangsa Moro pada tahun 1996.

Berdasarkan penjelasan tersebut, maka upaya yang dilakukan Indonesia untuk mendamaikan Filipina dan Gerakan Pembebasan Moro adalah meminta pemerintah Filipina hidup damai dengan umat muslim Moro.