Ekosistem perairan adalah ekosistem yang komponen abiotiknya didominasi oleh air. Ekosistem perairan dibagi menjadi dua, yaitu ekosistem air tawar dan ekosistem air laut.

Ekosistem terumbu karang terdapat di laut dangkal yang jernih, sehingga masih dapat ditembus oleh cahaya. Organisme yang hidup di antaranya hewan terumbu karang, hewan spons, mollusca, dan bintang laut.

^{sumber: divescover.com}

Gambar: Taman Nasional Laut Bawah Bunaken

Jadi, ekosistem yang dimaksud adalah ekosistem terumbu karang.

*Ekosistem air tawar lentik memiliki kadar garam rendah, dipengaruhi iklim dan cuaca, cahaya matahari kurang, dan air tenang. Contohnya adalah danau dan rawa.

*Ekosistem air tawar lotik memiliki kadar garam rendah, dipengaruhi iklim dan cuaca, cahaya matahari kurang, dan air mengalir. Contohnya adalah sungai dan air terjun.

*Ekosistem estuari memiliki kadar garam tinggi, tidak dipengaruhi iklim dan cuaca, terdapat di daerah percampuran air laut dan sungai. Contohnya ekosistem padang lamun dan mangrove (bakau).

*Ekosistem laut dalam memiliki kadar garam tinggi, tidak dipengaruhi iklim dan cuaca, tidak ditembus oleh cahaya.